北交所目前主要采用竞价交易、大宗交易、盘后固定价格交易及协议转让四种核心交易方式，同时经批准可引入做市商机制，为市场参与者提供了多元化的交易通道。
竞价交易是北交所最核心、最基础的交易方式，覆盖了绝大多数日常交易，分为开盘集合竞价、连续竞价与收盘集合竞价三个阶段。每个交易日9:15至9:25为开盘集合竞价，其中9:20前可撤单，之后则不能撤单，系统以此阶段申报撮合产生当日开盘价。9:30至11:30、13:00至14:57为连续竞价，投资者可进行限价与市价申报，交易按价格优先、时间优先原则实时撮合成交，且设有±5%的价格笼子限制，防止报价偏离过远。14:57至15:00为收盘集合竞价，仅接受限价申报且不可撤单，用于确定收盘价。竞价交易单笔申报以100股为起点，可1股递增，上限为100万股，日常涨跌幅限制为30%，新股上市首日不设涨跌幅。
大宗交易则专为大额交易设计，有效避免大额买卖对二级市场价格的冲击。其申报时间为每个交易日9:15至11:30、13:00至15:30，成交确认时间固定在15:00至15:30。参与门槛为单笔申报不低于10万股，或交易金额不低于100万元人民币，远高于普通竞价交易。成交价格方面，有涨跌幅限制的股票在当日涨跌幅范围内议价，无涨跌幅限制的股票则在前收盘价的70%至130%区间内确定。大宗交易成交信息会单独披露，不计入即时行情，为机构与大额投资者提供了高效的场外撮合渠道。
盘后固定价格交易是北交所的盘后补充交易机制，在收盘后以固定价格进行撮合，具体时间为15:05至15:30，交易价格为当日收盘价。该机制允许投资者在收盘后以统一价格成交，满足无法在盘中完成交易或希望规避盘中价格波动风险的需求，申报规则与竞价交易基本一致，但仅接受限价申报，成交同样按时间优先原则排序，有效提升了市场交易的灵活性与便利性。
协议转让是北交所的特殊交易方式，主要适用于因收购、股份权益变动、引进战略投资者等特定场景的股份转让，需向北交所单独申请。该方式不通过集中竞价系统，交易价格与数量由买卖双方协商确定，经交易所审核确认后完成过户，常用于大额股份的协议划转，是对集中交易机制的重要补充。北交所已引入做市商机制，做市商持续发布买卖双向报价，为股票提供流动性，进一步完善了市场的价格发现与交易功能。
