北交所的交易费率主要由交易佣金、印花税、过户费及经手费（或称规费）等部分构成，整体费率在资本市场中具备一定竞争力。其核心成本交易佣金费率一般默认在万分之三左右，但并非固定不变，投资者通过与证券公司协商，有机会获得更低的优惠费率。佣金的收取是双向的，即在买入和卖出股票时均需支付，且通常设有单笔最低5元的收费标准。印花税则仅在卖出股票时单向征收，税率为成交金额的千分之零点五。过户费费率极低，按成交金额的十万分之一双向收取。交易所收取的经手费等规费通常包含在券商设定的佣金之内。对于债券交易，北交所目前有暂免收取相关费用的优惠政策。了解并合理规划这些费用，是投资者参与北交所交易、控制交易成本的重要前提。
交易佣金是北交所交易费率中最主要且最具弹性的部分。该费率由各家证券公司自行设定，默认水平通常在万分之三上下浮动，最高不得超过成交金额的千分之三。这部分费用实际上包含了支付给交易所的经手费等多项成本。许多投资者在开通普通股票账户后，其北交所的交易佣金并不会自动同步为原有的低费率，往往仍会采用较高的默认标准，因此需要单独向券商申请调整。费率的高低与投资者的资金规模、交易频率以及开户渠道密切相关，资金量较大或交易活跃的投资者通过与客户经理协商，有望获得低于市场普遍水平的佣金率，部分券商针对新开户投资者可提供万分之二点五左右的优惠费率。
除佣金外，印花税和过户费是两项相对固定的成本。印花税作为国家税收，仅在投资者卖出股票时一次性收取，费率为成交金额的千分之零点五，买入环节不征收，且债券和基金交易免征此项费用。过户费则是在股票买卖双方之间转移所有权时产生的登记费用，目前按成交金额的十万分之一计算，买卖双向收取。这两项费用均由券商代扣代缴，投资者无法通过协商降低。在计算单笔交易的总成本时，必须将佣金、印花税和过户费叠加考虑，尤其对于小额或高频交易者，单笔最低5元的佣金门槛可能会显著拉高实际费率，建议通过合并委托单等方式来摊薄单位成本。
北交所的费率体系设计体现了其服务创新型中小企业的市场定位，通过结构化的收费项目和一定的协商空间来平衡市场活力与运营成本。投资者若想有效降低交易成本，关键在于主动管理佣金部分。最有效的方法是在开户前就联系券商的线上客户经理进行沟通协商，而非通过官方应用直接默认开户，因为客户经理通常拥有更大的费率优惠权限。对于已经开户的投资者，如果发现北交所佣金费率较高，可以联系原客户经理申请调低，但过程可能较为困难，此时选择一家提供低佣服务的新券商开户也是一个直接可行的方案。在选择券商时，不仅要关注佣金率本身，还应确认其报价是否为包含所有规费在内的全佣标准，以避免后续产生额外费用。
在参与北交所交易时，投资者还需关注其特殊的费用优惠政策。为降低市场成本、提升服务实体经济的效能，北交所持续对债券交易实施费用减免。根据相关通知，暂免收取债券现券交易的经手费、债券专用交易单元使用费等一系列费用的措施已延长至明年底。这一政策直接降低了债券投资者的交易成本。北交所整体的交易经手费标准经历多次下调后，目前已处于较低水平，这间接为投资者争取更低的综合佣金费率提供了空间。北交所的交易费率是一个由多个变量组成的动态体系，投资者需要全面了解其构成，并通过积极的渠道管理和策略选择，才能实现交易成本的最优化。
